重庆大学工会筹建于1951年3月。2000年5月，根据教育部的决定，原重庆大学、重庆建筑大学、重庆建筑高等专科学校合并组建新的重庆大学。2000年8月组建了新的重庆大学工会、教代会。2005年5月召开了第十二届工会会员暨第七届教职工代表大会，2021年12月召开了第十五届工会会员暨第十届教职工代表大会。

重庆大学工会下设三个专门委员会，分别是：文体工作委员会、青年教职工委员会和女职工委员会；重庆大学教代会下设三个专门委员会，分别是：福利委员会、学校财经工作监督委员会和提案工作委员会。全校目前有42个分工会及二级教代会，会员5100余人，专职工会干部11人，兼职工会干部227人，学校教职工代表大会代表343人。校工会下设工会办公室、文体工作部和福利工作部。

1982年12月，学校正式建立了教职工代表大会制度，1985年起以原重庆大学热力系为试点单位，陆续在二级单位建立了教职工代表大会制度，逐步实现了教职工代表大会制度化、规范化。2000年合校后，设有二级党组织的二级单位均建立了教职工代表大会制度。

重庆大学工会、教代会以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，贯彻落实新发展理念，贯彻落实党的二十大精神和中国工会十八大精神，深刻领会教育部颁布的《学校教职工代表大会规定》精神内涵，坚持走中国特色社会主义工会发展道路。在学校党委和上级工会的领导下，在学校行政的大力支持下，围绕学校中心工作，服务大局，突出特色，主动作为，团结凝聚全校教职工，为学校的“双一流”建设贡献力量。

重庆大学工会2002年被重庆市总工会授予“重庆市模范职工之家”光荣称号。2005年被中华全国总工会授予“全国模范职工之家”光荣称号，全国教科文卫体工会授予“全国教科文卫体系统先进工会组织”。2006年被中华全国总工会授予“全国五一劳动奖状”。2009年被重庆市教育工委、重庆市教委、重庆市教科文卫体工会授予“重庆市民主管理示范学校”，重庆市总工会授予“重庆市工会维护农民工合法权益先进集体”2010年被授予“重庆市厂务公开民主管理先进单位”。2013年所获奖励：重庆市总工会颁发的“重庆市教科文卫体系统先进工会组织”、“重庆市教科文卫体系统女职工工作先进集体”，重庆市教科文卫体工会颁发的“重庆市高校工会工作综合竞赛特等奖”，重庆市总工会女职工委员会颁发的“2013年女职工权益保护优秀品牌奖”。2017年被授予“全国厂务公开民主管理先进单位”。